○生物系特定産業技術研究支援センター基礎研究推進事業
2003〜2007年度
「クローンブタを用いた幹細胞移植治療の評価モデルの確立」（研究代表者）
http://brain.naro.affrc.go.jp/tokyo/marumoto/up/book/19.pdf
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○科学技術振興機構 戦略的創造研究推進事業 ERATO 中内幹細胞制御プロジェクト
2007〜2012年度
（研究分担者 大動物モデル研究 グループリーダー）
http://www.jst.go.jp/erato/project/nks_P/nks_P-j.html
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○文部科学省 私立大学学術研究高度化事業 ハイテク・リサーチセンター
2001〜2008年度
「21世紀の食糧生産・生物活用のためのバイオテクノロジー」 （研究分担者）
http://www.isc.meiji.ac.jp/~rf00001/igi.html
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○文部科学省 私立大学学術研究高度化事業 学術フロンティア推進事業
2006〜2010年度
「高度先端医療を支援するハイパフォーマンスバイオマテリアルの創製と
その医療用デバイスとしての応用」
（研究分担者）
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○生物系特定産業技術研究支援センター基礎研究推進事業
1996〜2000年度
「臓器移植医療に応用するためのブタの品種改良・増産に関する研究」（研究分担者）
http://brain.naro.affrc.go.jp/tokyo/marumoto/up/h8seika/13sirokura.html
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主な研究プロジェクト（研究代表及び分担）
